Préchauffer le four à 160°C.
Beurrer généreusement un plat à gratin.
Faire chauffer la crème à feu doux avec l'ail écrasé, le thym, le sel, le poivre et la muscade pendant 10 minutes sans faire bouillir.
Retirer l'ail et le thym puis réserver la crème chaude.
Trancher finement les pommes de terre et les courgettes à l'aide d'une mandoline (environ 2 mm d'épaisseur).
Déposer une couche de pommes de terre dans le fond du plat.
Ajouter une couche de courgettes puis parsemer un peu de comté râpé.
Assaisonner légèrement de sel et de poivre.
Répéter les couches jusqu'à épuisement des ingrédients.
Terminer par une dernière couche de pommes de terre puis recouvrir généreusement du reste de comté râpé.
Verser la crème infusée chaude sur l'ensemble du gratin jusqu'à presque couvrir les légumes.
Enfourner pendant 1 heure à 1 heure 15 minutes jusqu'à ce que les légumes soient tendres et le dessus bien doré.
Vérifier la cuisson avec la pointe d'un couteau qui doit s'enfoncer sans résistance.
Laisser reposer 10 minutes avant de servir.